污泥可能包括雨水径流或城市径流。能够处理雨水的污泥系统被称为组合下水道系统，这种设计在19世纪末和20世纪初首次开发并使用到污泥烘干机的污泥处理系统中，且是当时较为常见的。混合下水道比卫生下水道需要更大和更昂贵的处理设施。大量的暴雨径流可能会淹没污泥处理系统，造成溢出或溢入。
　　
　　卫生下水道通常比联合下水道小得多，并且不设计用于输送雨水。如果允许过多的渗透/流入（由雨水和/或地下水稀释）进入卫生下水道系统，则可能发生原污泥的备用。在20世纪中期或之后城市化的社区通常建立单独的系统用于污泥（污泥下水道），因为降水会导致流量的变化，降低污泥处理厂的效率。
　　
　　随着降雨在屋顶和地面上行进，它可能吸收各种污染物，包括土壤颗粒和其他沉积物，重金属，有机化合物，动物废物，油和油脂。一些法域要求雨水在直接排放到水道之前得到一定程度的处理。用于雨水的处理方法的实例包括保留盆地，湿地，具有各种介质过滤器的掩埋穹窿以及涡流分离器（以去除粗固体）。